Manhattan Project: Energy Empire obsahuje kompletní obsah původní hry spolu s rozšířením Cold War, novým rozšířením UN Envoys a dalším bonusovým obsahem.
Hra se odehrává ve druhé polovině 20. století, kdy jednotlivé národy usilují o růst svého vlivu a moci. Hráči přebírají kontrolu nad vlastním státem a rozvíjejí jeho průmysl, obchod a vládní instituce prostřednictvím získávání zdrojů, výstavby budov a využívání energetických zdrojů.
Největší hrozbou v Energy Empire nejsou vojenské konflikty, ale globální důsledky industrializace a znečištění. Mnoho akcí přináší vedlejší efekty v podobě rostoucího znečištění, které může ovlivnit průběh hry. Využití vědy pomáhá zmírňovat negativní dopady průmyslu a přispívá k řešení globálních krizí.
Hra využívá mechaniky worker placement, tableau-building a resource management. Během svého tahu si hráč vybírá mezi akcí Work nebo Generate. Při Work umisťuje pracovníka na herní plán a aktivuje karty ve své herní oblasti pomocí pracovníků a energie. Díky možnosti utrácet energii za obsazená pole nejsou akční prostory nikdy zcela zablokovány.
Při akci Generate si hráči obnovují zásoby energie pomocí energy dice, které představují různé zdroje energie včetně jaderné energie, uhlí, ropy, solární energie a dalších forem.
Oboustranný herní plán umožňuje plynulé propojení základní hry a rozšíření do jednoho komplexního herního zážitku. Obsah nového rozšíření byl vytvořen exkluzivně pro toto vydání a není dostupný samostatně.