Emerald Echoes je příběhové logické dobrodružství s krásně ilustrovanými hádankami a fyzickými artefakty. V roli historického badatele postupně odhalujete příběh legendární alchymistky a jejích společníků. Děj je rozdělen do čtyř kapitol a hra představuje samostatné pokračování titulu The Emerald Flame.

Každá kapitola obsahuje kolekci neoznačených předmětů a zelené složky s hádankami, které se řeší v číselném pořadí. Součástí hry jsou také modré složky, které neobsahují hádanky, ale postupně rozvíjejí příběh.

Každá zelená složka obsahuje alespoň jeden psaný dokument, který slouží jako výchozí bod při zkoumání a určování, které předměty budete potřebovat k vyřešení hádanky. Nechybí ani karta Analysis, která nabízí postupné nápovědy i řešení každé hádanky.